6月1日，市疾控中心徐勇、罗水斌和余华被推选为第三届内江市卫生健康委学科带头人。《内江市卫生健康委员会关于公布第三届内江市卫生健康委学科带头人名单的通知》（内卫办发【2021】49号）。
6月1-2日，为突出防范域外输入疫情工作重点，严格集中隔离医学观察场所管控，切实阻断疫情输入渠道，根据《四川省卫生健康委员会关于开展全省常备集中隔离场所风险隐患排查的通知》要求，中心联合内江市卫生和计划生育监督执法支队，监督抽查了50%以上的全市疫情防控常备集中隔离医学观察场所。
6月2日，市疾控中心完善和印发了《中心网络安全责任制度》强化中心网络安全责任制，自6月20日起，提高每天监测网络舆情频次，强化网络安全值守。严格落实《内江市疾病预防控制中心关于切实加强网络信息安全的通知》要求，全面做好中心网络信息安全，为庆祝建党100周年网络安全保障奠定基础。
6月3日，市疾控中心承办全市学校卫生启动会暨监测技术培训班。省疾控中心专家周亮、市卫生健康委副主任罗仁福、市教育局副局长封武、市疾控中心副主任杨军到会指导。市教育局和市卫生健康委相关科室负责人、各县（市、区）卫生健康局、教体局分管领导和相关科室负责人、各县（市、区）疾控中心分管领导和相关科室负责人、市直属学校分管领导共计60余人参加培训。通过培训，参训人员进一步掌握了学校卫生工作的新知识、新技能，为全面加强我市学校卫生工作奠定了坚实的基础。
6月3-4日，在市卫生健康委统一安排下，中心联合内江市卫生和计划生育监督执法支队对全市高中考考点开展考前监督检查工作，重点检查了考点防疫准备、考场设置等，筑牢了疫情防控和中、高考安全防线。
6月4日，市疾病预防控制中心举办内江市新冠疫苗大规模接种暨2021年免疫规划第一季度工作通报培训班。此次培训，总结了新冠疫苗第一剂接种工作中存在的问题，为下阶段新冠疫苗第二剂接种规范开展提出工作要求，确保安全、有序完成接种任务。
6月4日，市疾控中心举办了2021年全市艾滋病综合监测培训班，各县（市、区）疾控中心、县级及以上医疗机构防保科业务骨干，各艾滋病哨点监测单位相关工作人员共40余人参加培训。通过培训，进一步梳理了2021年工作重点，剖析了艾滋病综合监测工作中存在的问题，为下一步科学规范开展艾滋病防治工作、顺利完成监测任务提供了有力支撑。
6月7日，中心科研项目《内江市登革热传播媒介白纹伊蚊监测、控制策略及应用研究》完成提名书的填报。
6月7日，按照《2021年疾病防控救治能力提升及州县疾控机构专业技术人员进修项目实施方案的通知》要求，中心带领凉山州甘洛县和甘孜州新龙县的两名进修学员前往隆昌市伯育幼儿园、隆昌市疾控中心开展手足口病聚集性疫情现场流行病学调查和新冠肺炎常态化监测技术指导。此次带教旨在夯实进修人员专业知识基础，提高进修人员现场流行病学业务技能，把握当前疫情防控形势，不断增强流行病学调查的看家本领。
6月7-18日，市疾控中心纪委书记刘建伟带队，对照《国家基本公共卫生服务规范（第三版）》、市爱卫办《2021年健康促进与健康教育工作重点任务》要求，对各县（市、区）疾控中心健康教育工作予以了技术指导，并抽查了永安镇卫生院等10所基层医疗卫生机构。
6月9日，中心举办内江市2021夏秋季重点传染病防控技术培训班，此次培训邀请省疾控中心肖崇堃副主任医师授课，详细讲解了传染病防控和现场流行病学调查步骤。进一步提高了基层医疗机构和疾控机构对新冠肺炎、手足口病、流感等疾病的监测水平和疾病防控能力，为做好我市传染病防治工作奠定了基础。
6月9日，中心召开新冠肺炎分析研判会，会上通报了境外疫情、国内疫情、病毒变异和疫苗接种情况，会后，参会人员根据疫情发展形势，结合工作实际，从如何加强疫情研判分析，如何把握疫情防控关键环节以及如何科学落实重点人员管理等方面，对做好下一步疫情防控提出意见建议。
6月15-18日，按照《内江市应对新型冠状病毒感染肺炎疫情应急指挥部办公室关于印发<新冠肺炎疫情常态化防控督查工作方案>的通知》（内疫办发〔2021〕77号）文件要求及有关领导安排部署，中心联合市委政法委、市委纪委监委及市妇幼保健院组成的第五督查组，对照《内江市2021年新冠肺炎疫情防控工作指南（第三版）》，通过现场走访询问、查阅资料及访谈群众等方式，对威远县应对疫情指挥部、威远县人民医院等10个重点行业、部门新冠肺炎疫情常态化防控及新冠病毒疫苗接种工作开展了督查。
6月16日，内江市疾控中心作为四川省首批疫苗临床研究基地接受四川省疾病预防控制中心统一授牌，标志着疫苗临床研究基地正式落户内江。同时，市中区疾控中心、资中县疾控中心、威远县疾控中心也一并被授予疫苗临床研究基地。
6月17日，市疾控中心被评为“2020年度预算管理先进单位”。内江市财政局关于2020年度市级预算管理先进单位的通报（内财预【2021】19号）。
6月19-20日，市疾控中心派出4名应急队员前往资中县，对成都市初筛阳性病例的4名密切接触者的密切接触者排查进行技术指导。指导资中县第一时间落实管控措施，第一时间开展流调，第一时间开展核酸检测，以第四届开展次密摸排，事件得到有效处置，既保护了经济社会稳定，也对疫情进行了精准处置。
6月21日，中心召开安全生产暨信访维稳工作会。各分管领导、全体中层干部共计30余人参加了会议。会上，中心党委书记、主任罗文斌传达了全省卫健系统安全生产电视电话会议精神，要求中心安全检查组、各科室要全面开展安全隐患排查，建立责任清单，落实整改。与会人员同时观看了《安全重于泰山》警示教育片。
6月22日，内江市疾病预防控制中心党委书记、主任罗文斌带队一行5人到重庆美莱德生物医药有限公司就深化合作事宜进行洽谈。经双方洽谈，签订了战略合作协议，在疫苗、新器械、新试剂的开发和应用等方面深化“产、学、研”合作机制，建立信息、技术、人员、物资等资源共享平台，联合开展科研项目的申报和攻关，实现社会效益与经济效益双赢、研究成果共享。
6月23日，分管领导组织等评办人员对各科室等级复评审相关指标的印制资料、档案组卷等情况进行逐一检查，梳理出目前还存在主要问题，形成专题报告。
6月24日，省放射卫生技术服务质量控制中心专家组李长虹等一行5人莅临我市，对市疾控中心进行了放射检测的实操考核。本次质控考核为提升中心放射卫生检测工作质量，保障检测数据和检测结果的可靠性、准确性、规范性奠定了基础，同时，也为下一步工作的开展提出了新的更高的要求。
6月24-25日，在市卫生健康委的组织领导下，市疾控中心组织专业技术人员参加四川省基本公共卫生服务均等化指导中心对内江市基本公共卫生服务项目居民健康档案、肺结核患者健康管理、预防接种管理等项目内容的现场技术指导。 通过省级现场指导，进一步掌握了我市居民健康档案管理中存在的问题，为下一步工作重点提供了参考依据。
6月25日，市疾控中心余华同志被评为“市直机关优秀共产党员”。《中共内江市直机关工委关于表彰市直机关优秀共产党员、优秀党务工作者和先进基层党组织的决定》（内工委发【2021】1号）。
6月29日，内江市疾控中心召开庆祝中国共产党成立100周年暨“七一”表彰大会。会议由疾控中心党委副书记朱笛主持，党委班子成员、离退休老党员、中心在家党员等60余人参加此次大会。会上对16名优秀党务工作者、优秀共产党员和2个先进基层党组织进行了表彰。中心党委书记罗文斌代表中心党委，向受到表彰的先进集体和优秀个人表示热烈的祝贺，并指出，召开庆祝中国共产党成立100周年暨“七一”表彰大会，是为了更好地回顾党的光辉业绩，发扬党的优良传统，表达对党的无限忠诚与热爱之情。全体党员要始终铭记嘱托，始终不忘初心，全心全意为人民服务，以人民健康为中心；在新征程中，牢记使命，做好健康促进，以让群众不得病、少得病、不得大病为己任，抓好疾病防控各项工作。
6月29日，在中国共产党建党100周年来临之际，内江疾控中心党委书记罗文斌、党委副书记朱笛为在党50周年退休老党员发放“光荣在党50周年”纪念章并致以亲切的问候和崇高的敬意。对结防支部党员、吴俊寰烈士遗属周芳芳同志和在新冠疫情防控中表现突出的老党员“内江钟南山”罗永革同志进行慰问。
6月30日，丽珠集团临床运营总经理孔祥生一行，到内江市疾控考察疫苗临床基地工作。市疾控中心党委书记、主任罗文斌，副主任徐勇陪同。经洽谈，双方对新冠变异株1期临床研究达成初步意向，拟在7月中上旬签订合作协议。
6月30日，省药审中心对内江市疾控中心开展检查，通过听取汇报，查看资料的方式，省药审中心重点查看了SAE报告，妊娠报告，方案，伦理资料，对内江现场项目工作给予了好评。
6月，新冠疫苗上市后临床研究项目在威远县启动。截至6月28日，威远县新冠疫苗项目累计入组15927人（第一剂接种人数），累计完成第二剂接种15109人，第二剂接种完成率为94.86%。中心于6月中旬、下旬对此项目第二剂接种、日记卡填写、相关资料收集等工作进行全环节技术指导，及时发现工作中存在问题，并提出整改建议，确保各环节工作按照项目方、负责机构要求规范开展。
6月，市疾控中心班子成员带领专业技术人员，对各县（市、区）新冠疫苗接种点、市直医疗机构接种点，就接种现场人员管理、接种点设置、疫苗管理、冷链管理、接种实施过程、疑似预防接种异常反应监测和处置、医疗保障、四川省免疫规划信息系统离线客户端安装和操作重点内容开展技术指导，全力助推我市新冠疫苗第一阶段第二剂次接种工作。截至6月25日9时，累计接种新冠疫苗2201632剂次，其中接种第一剂1139403剂次，第二剂1062229剂次，第二剂任务完成率达100.02%，全市106.2万第二剂次接种任务圆满完成。
6月，市疾控中心先后为内江市第七届人大八次会议、庆祝党百周年大型歌咏会提供核酸保障，开展核酸检测1000余人；派出专业人员20人次，参与市第七届人大八次会议、市委七届十三次全会、庆祝党百周年大型歌咏会、绵泸高铁内自泸段通车启动仪式等15场大型会议、活动疫情防控保障，其中开展事前指导6人次，现场保障14人次。
6月18日，内江市疾控中心举办2021年全市寄生虫病防治技术竞赛，全市5支代表队、20名专业技术人员参加了本次竞赛。此次比赛得到了四川省疾病预防控制中心的大力支持，省疾控中心寄防所所长刘阳和寄生虫防治专家田洪春、郁涛亲临现场，在赛前为选手进行理论培训和现场指导。本次竞赛，以赛促学、以赛促训，进一步加强了全市医疗卫生机构的寄生虫病防治人才和技术储备，为专业人员搭建了一个相互学习、展示才干的平台，增强了能力和凝聚力，为推动全市寄生虫病防治工作再上新台阶夯实了基础。